miRNA、mRNA、iTRAQ整合分析

学通, 刘 行业资料评论338阅读模式

一、技术简介:

miRNA是一类长度约20-24nt的具有调控功能的非编码RNA,在生物体内,miRNA主要通过与靶基因mRNA结合,介导靶mRNA的翻译抑制(动物)或剪切降解(植物),而蛋白质作为mRNA的翻译产物,其表达量也会受到影响。通过研究miRNA-mRNA-蛋白质之间的相互作用关系,可以系统的研究基因表达调控机制。

二、技术路线:

miRNA、mRNA、iTRAQ整合分析

三、分析内容:

1.三组学关联总表
A.GO分析
B.靶基因GO功能注释
C.关联蛋白KEGG分析
D.靶基因KEGG功能注释
E.显著富集的功能和通路分析
2.个性化关联分析内容
A.关联数据表达模式聚类
B.关联数据网络图
C.蛋白互作网络图

四、样本类型:

1、细胞,组织,体液、血清、血浆、全血,总RNA、总蛋白等;

2、建议总RNA起始量:10μg,最低4μg,浓度≥120ng/μL;

3、建议总蛋白起始量(单次):≥500μg,浓度≥1μg/μL。

五、代表性文章:

WangC,LiuCM,WeiLL,etal.AGroupofNovelSerumDiagnosticBiomarkersforMultidrug-ResistantTuberculosisbyiTRAQ-2DLC-MS/MSandSolexaSequencing.IntJBiolSci2016;12(2):246-256.doi:10.7150/ijbs.13805.

miRNA、mRNA、iTRAQ整合分析

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学通, 刘
  • 本文由 发表于 2023年9月5日 16:36:02
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匿名

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