菌种鉴定

分子实验——菌种鉴定

实验介绍

菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA,然后PCR扩增16s rDNA片段,上机测序之后,上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在99%以上就可以认为是同一个种细菌。

 

实验步骤

(1)样品DNA提取:根据DNA提取试剂盒步骤进行即可。

(2)PCR扩增:将提取的DNA作为PCR模板,引物为细菌16SrDNA,真菌ITS1/4通用引物组合;

菌种鉴定-1

(3)克隆测序


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