Label free蛋白质谱简介

martin 蛋白组评论47阅读模式

一、技术简介:

Label-free(蛋白质非标记定量技术)是通过LC-MS/MS技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用稳定同位素标签,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

二、实验流程:

蛋白质样本—实验预判—Trypsin—LC-MS/MS—蛋白质定性定量—数据分析(*包括蛋白质定量、SDS-PAGE测试、酶解和质谱分析,对样本质量及样本之间的平行性进行初步判断) 。

三、技术优势:

1、无需昂贵的同位素标签做内部标准,实验耗费低;
2、对样本的操作少,从而使其最接近原始状态;
3、不受样品条件的限制,克服标记定量技术在对多个样本进行分析方面的缺陷;
4、对实验操作稳定性、重复性要求高,要求至少做三次生物重复。

四、应用方向:

1、农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

2、 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

3、 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

4、生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

5、微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

6、海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

7、 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

8、食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

五、数据分析:

1、蛋白质鉴定结果统计表;

2、蛋白质定量结果统计表;

3、GO功能注释统计表;

4、KEGG通路注释统计表;

5、蛋白质表达火山图;

6、差异表达蛋白质聚类分析;

7、差异表达蛋白质GO注释分析;

8、差异表达蛋白质KEGG通路分析;

9、KEGG通路图详细展示;

10、差异表达蛋白质构建蛋白质互作网络图。

Label free蛋白质谱简介

 

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martin
  • 本文由 发表于 2025年3月20日 12:03:50
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匿名

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